A l'àrea de treball del JClic Autor es troben la barra de menús i les 4 pestanyes en què s'organitzen les diferents eines del programa.

Aquestes pestanyes són:

• Projecte: des d'aquí s'introdueixen i/o modifiquen les dades generals del projecte. És la que apareix en pantalla quan s'obre el programa.
• Mediateca: des de la mediateca es gestionen les imatges i els altres recursos multimèdia emprats al projecte. Cal activar la pestanya Mediateca per afegir, esborrar o visualitzar els recursos multimèdia del projecte i les seves propietats.
• Activitats: des d'aquí es creen i/o modifiquen les activitats del projecte.
  Aquesta pestanya conté quatre apartats (pestanyes), tres dels quals són iguals per a tots els tipus d'activitats (Opcions, Finestra i Missatges) i un que varia en funció del tipus d'activitat que s'estigui creant o modificant, la pestanya Plafó.

• Seqüències: a la darrera pestanya del JClic Autor hi ha les eines per crear i modificar seqüències d'activitats. Des d'aquí es determina l'ordre en què es presentaran les activitats i com s'han de comportar els botons d'aquestes activitats.

Des de la barra de menús del JClic Autor s'accedeix a opcions d'obrir i desar fitxers, funcions d'edició i accés a les diferents pestanyes.

Des del Menú Eines s’accedeix a les opcions de configuració del programa i a les utilitats que permeten crear pàgines web i instal·ladors dels projectes.

Aquestes utilitats es veuran amb detall al mòdul 5 del curs.